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单细胞测序技术研究癌症之通路富集分析

“一只南美洲亚马逊河流域热带雨林中的蝴蝶,偶尔扇动几下翅膀,可以在两周以后引起美国得克萨斯州的一场龙卷风。”这是对“蝴蝶效应”最为常见的叙述。事实上,癌症的发生发展是一个类似“蝴蝶效应”的过程。...

单细胞RNA测序技术揭示癌症发生发展过程

​单细胞RNA测序技术与伪时间轨迹分析法相结合,模拟癌组织内单个细胞间转录组的变化,帮助研究者构建癌症的发生发展过程,为攻克癌症这一疑难杂症提供高可信度的基础资料。 本期将介绍两个应用实例——儿童小脑肿瘤

单细胞测序研究癌症之肿瘤微环境研究

单细胞RNA测序通过对测序数据进行降维聚类,从而获得肿瘤组织的异质性;同时对聚类后的某一细胞群研究,如标记基因表达水平、通路相关基因集表达水平等对聚类降维图中的细胞聚群进行标识,有望发现新的细胞亚型,帮助

高通量单细胞转录组测序技术的起源

2015年《Cell》同期发表了两篇基于液滴微流控技术的高通量单细胞转录组测序新方法——InDrop【5】和Drop-seq【6】,均采用了哈佛大学医学院大卫·韦茨院士研发的液滴微流控芯片,实现了几千个单细胞转录组数据的获得与

RedRock超高通量单细胞转录组测序

单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq被掩盖的细胞群内的转录组异质性难题, 有助于发现新的稀有细胞类型,并深入了解发育过程中的表达调控机制。...

偏爱东亚人的恶性肿瘤——胃癌

胃癌是一种常见的恶性肿瘤,因其预后较差而严重威胁着人类的健康。全球每年新发胃癌病例约120万,中国约占其中的40%。我国早期胃癌占比很低,仅约20%,80%以上的患者被确诊时已是中晚期,总体5年生存率不足50%。...

它不是痔疮,它是结直肠癌!

90%以上的直肠癌病例在初期会被误诊为痔疮而贻误了最佳治疗时间,最终确诊为结直肠癌时往往已是中晚期了!通过结肠镜检查发现并切除息肉可降低结直肠癌的患病风险,对于一般风险人群,通常在50岁时开始筛查;而对于

新生抗原疫苗——个体化肿瘤治疗方案

肿瘤新生抗原是一类非常合乎理想的免疫原,它们产生于肿瘤的体细胞突变,是肿瘤特异性抗原,这使得新生抗原相关的免疫疗法成为一种真正的个性化疗法,而由于个体间肿瘤新发瘤的多样性,开发个性化的癌症疫苗是非常必

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